De primera instancia la Facultad de Enfermería se adscribe a los convenios macros que ha promovido la Universidad Autónoma de Querétaro con las instituciones de salud del estado. Sin embargo, actualmente se están promoviendo los convenios específicos de colaboración con diversas instituciones de salud del sector privado del estado.
Así como con instituciones públicas y privadas a nivel nacional, de tal forma que el estudiantes del programa de la Especialidad de Enfermería con línea terminal en Cuidados intensivos/Quirúrgica/Urgencias, pueda vincularse en la estancia profesional con organizaciones que atiendan directamente a demandas específicas del paciente/usuario y/o familia en estado crítico, con el fin de promover el desarrollo de trabajos colaborativos entre las instituciones involucradas. A continuación se hará mención de algunas de las instituciones con las que se estaría vinculando el estudiante y cuerpo docente de la Facultad de Enfermería:
● Nivel estatal:
§ Secretaría de Salud del Estado de Querétaro (SESEQ).
§ Instituto de Seguridad y Servicios Sociales de los Trabajadores del Estado (ISSSTE).
§ Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS).
§ Privados: Hospital Santo Tomás, Hospital Ángeles, San José, Hospital H+, Hospital Star Médica, entre otros.
● Nivel nacional:
§ Hospital Central Militar.
§ Hospital Juárez de México.
§ Universidad Autónoma de San Luis Potosí.
§ Benemérita Universidad Autónoma de Puebla.
§ Universidad Autónoma de Yucatán.